巴西發現新「神秘」病毒？
本來想寫肺炎科普，未有時間追晒咁多學術文章同埋云云fake news，遲D睇下有無機會。
Sorry有少少標題黨，今日想分享嘅其實主要唔係喺巴西發現病毒一篇，而係另一篇已經發表嘅論文，關於分析大量病毒序列後，發現幾百段未能被歸類嘅序列。呢段報導見咗好幾日，因為U Travel 啱啱有title 話「巴西驚現全新神秘病毒」，BusinessFocus都係，大家留言都話好驚，講到由此見到世界末日咁，所以分享下。
U Travel 呢道講嘅一篇喺1月28日喺未經同儕審閱嘅論文預印本資料庫(bioRxiv)公開嘅文章：
驟眼睇無咩明顯問題，不過想講幾樣嘢：
- 首先，款病毒係感染阿米巴變型蟲嘅，好可能感染唔到你
- 分析搵到74隻基因，有6隻搵到相似。序列未發表，無從置評
- 雖然個反思話我地對於病毒仲病好多嘢未知都係老生常談*，不過都值得提醒嘅，所以請睇埋以下
呢道分享嘅係另一篇2月4日發表嘅學術論文，原文第一句就係
Although millions of distinct virus species likely exist, only approximately 9000 are catalogued in GenBank’s RefSeq database.
恒河沙數嘅病毒入面，只有大概九千隻有被一大資料庫記載。Tisza et al. 美國一組研究人員用七十個隻動物樣本，尋找有環狀DNA序列嘅病毒，並開發咗一款新嘅用neural network從基因序列相似度推算基因作用（”functional annotation”)嘅方法。
喺2514段序列入面，佢哋發現大部分同已知嘅病毒相似，包括868隻擁有同款複製相關蛋白以及相似基因組結構，但未被仔細研究分類嘅CRESS病毒^，另有609段檢測到嘅環狀DNA序列並未搵到同已知病毒相似。甚至有基因組似乎由單鏈DNA 同單鏈RNA病毒組合而成，顯示病毒演化不只位點變異，亦可透過同其他病毒組合變異，以及CRESS病毒喺病毒演化上有相當地位，頗有意思。
另外，細菌都有益菌害菌，報導亦提到病毒都有會維持健康嘅。其實大自然好大，好多嘢一直存在，而人類所知好有限。想像自己係一隻蚊，你飛入超市發現蚊拍、殺蟲水，唔代表全超市嘅嘢都係嚟殺你嘅。
兩篇論文都係open access，有興趣不妨睇睇。
Viral novelty doesn’t surprise Elodie Ghedin of New York University, who looks for viruses in wastewater and in respiratory systems. More than 95% of the viruses in sewage data have “no matches to reference genomes [in databases],” she says. Like Abrahão, she says, “We seem to be discovering new viruses all the time.”
PS1：本來係個人Facebook分享，諗諗下不如share出嚟，緣起又係香港post，所以寫住粵文先。
PS2：科學日新月異，第一篇文比對咗八千幾隻已知病毒序列，好彩第二篇文用嘅二千五百幾隻病毒序列係已經published，論文新、raw data唔新，否則reviewers好可能會叫第一篇作者再做過個分析😛）
*有咩係知晒嘅？知晒就唔使研究啦😅 tbh，研究發表係一定會擺，既係真實，亦係PR
^Circular replication-associated protein (Rep)-encoding single-stranded DNA (CRESS) — 複製相關蛋白編碼環型單鏈DNA病毒
